Ubaya melaksanakan penelitian dengan mengacu pada tiga pilar sustainabiliy, yaitu: lingkungan, sosial, dan ekonomi. Kegiatan penelitian difokuskan pada upaya untuk mengembangkan teknologi ramah lingkungan, mendukung peningkatan kualitas hidup sosial, dan mendukung terciptanya tata kelola bisnis yang baik. Dengan itu dirumuskan 3 klaster penelitian yaitu: green technology, healthy living, dan sosial humaniora.